課程資訊
課程名稱
環境職業醫學研究法
Research Methods of Environmental and Occupational Medicine 
開課學期
110-1 
授課對象
公共衛生學院  公共衛生學系  
授課教師
楊孝友 
課號
EOHS7019 
課程識別碼
852 M0190 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期三8,9(15:30~17:20) 
上課地點
公衛209 
備註
與鄭尊仁、王榮德、邱嘉斌合授
總人數上限:24人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1101EOHS7019_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程第一階段將帶領學生學習如何系統性文獻回顧與整理,完成meta-analysis。機械學習已廣泛應用於疾病篩檢預測,也是跨入健康大數據分析的基礎。本課程將step-by-step方式,帶領學生機械學習統計分析。分析健康檢查、質譜儀、感測器、空氣汙染資料。進行疾病發生之預測。流行病學發現,通常須進一步以動物實驗驗證其致病機轉。本課程以空氣汙染對健康危害為例,介紹動物研究的發想與進行方式。  

課程目標
完成此課程同學能夠:
1. 具備系統性文獻回顧能力(無經費、資源少也能發表!)
2. 具備R程式語言與機械學習能力 (精準醫學統計一次搞懂!)
3. 應用新的研究方法與環境職業健康領域研究。 (跟著國際學者走,讓你寫作投稿都上手!)
 
課程要求
碩博士班及大學部高年級

本學期因疫情之故,前三週(9/22-10/12)全面實施線上授課;由授課老師於課前寄送視訊會議連結至學生學校信箱,請修課同學注意。後續上課方式,將配合學校防疫規定。 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
待補 
參考書目
1. Ding-Geng (Din) Chen, Karl E. Peace. Applied Meta-Analysis with R. 1st edition, New York, USA: Chapman and Hall/CRC; 2013. (ISBN-13: 978-1-4665-0599-5)
2. Brett Lantz. Machine Learning with R. 2nd edition, Birmingham, UK. Packt Publishing Ltd; 2013. (ISBN: 978-1-78439-390-8)
 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/22  Introduction―Precision public health

【本學期因疫情之故,前三週(9/22-10/12)全面實施線上授課。後續上課方式,將配合學校防疫規定。】

U-meeting線上上課:環境職業醫學研究法-第一週(9/22)
上課時間:2021/09/22 15:30 ~ 2021/09/22 17:30
請於指定的時間按一下以下項目來加入會議:
https://u.cyberlink.com/meeting/283334877
會議 ID:283-334-877 
第2週
9/29  I. Meta-analysis
(1) How to conduct a systemic review (楊孝友)
【Hand on exercise】: basic R data structure and language (楊孝友)

U-meeting線上上課:環境職業醫學研究法-第二週(9/29)
會議時間:2021/09/29 15:30 ~ 2021/09/29 17:30
請於指定的時間按一下以下項目來加入會議:
https://u.cyberlink.com/meeting/479941501
會議 ID:479-941-501 
第3週
10/06  (2) Meta-analysis―Fixed/random effect, forest plot, funnel plot (楊孝友)
【Hand on exercise】: R packages of rmeta, meta

U-meeting線上上課:環境職業醫學研究法-第三週(10/6)
會議時間:2021/10/06 15:30 ~ 2021/10/06 17:30
請於指定的時間按一下以下項目來加入會議:
https://u.cyberlink.com/meeting/364157507
會議 ID:364-157-507 
第4週
10/13  (3) Meta-analysis―Meta-Regression (楊孝友)
【Hand on exercise】: R packages of meta

https://join.skype.com/vMnCbg0Hkex3 
第5週
10/20  (4) Meta-analysis―Dose-response meta-analysis in occupational environmental epidemiological study (楊孝友)
【Hand on exercise】: R packages of dosresmeta, rms  
第6週
10/27  (5) Meta-analysis of screening accuracy (楊孝友)
【Hand on exercise】: R packages of mada 
第7週
11/03  傳染病傳播模式分析 (邱嘉斌)
Infectious diseases transmission modeling 
第8週
11/10  期中報告繳交 
第9週
11/17  II. Machine learning
Machine learning in precision public health (楊孝友)
【Hand on exercise】: Forecasting Numeric Data  
第10週
11/24  Machine learning : Random Forests (楊孝友)
【Hand on exercise】: R package of randomForest  
第11週
12/01  Machine learning: Support Vector Machines (楊孝友)
【Hand on exercise】: R package of Kernlab 
第12週
12/08  Machine learning: Artificial Neural Networks (楊孝友)
【Hand on exercise】: R package of neuralnet  
第13週
12/15  Deep learning (簡廷因/楊孝友)
【Hand on exercise】R package of Keras 
第14週
12/22  How to conduct in vivo studies (鄭尊仁) 
第15週
12/29  Evaluation of cancer screening—QALY (王榮德)  
第16週
1/05  期末報各繳交